Pocillopora verrucosa（疣状杯形珊瑚）是重要的礁前珊瑚，分支粗壮，生长快速，其个体最大直径可以生长到2米以上，具有形成生物水下消波块的能力，对生物造礁、护礁、固礁至关重要，是海洋建设土交材建工程的良好补充。2024年7月7日，NCBI
(National Center for Biotechnology
Information)公布了全球旗舰基因组质量排名 (NCBI RefSeq), 东南大学组装的造礁珊瑚 (Pocillopora
verrucosa, GCF_036669915.1) 基因组被排在首位[1, 2],
其测序、排污、组装、注释质量全球最佳[3]。
从2022年开始，生物基因组研究进入了颠覆性质变时代。造礁珊瑚是珊瑚礁生态修复的核心物种，具有与虫黄藻等多种共生生物终生共同生存的特点。该特点使得其基因组是动物界中最难组装到染色体水平的基因组。东南大学数字医学工程全国重点实验室陆祖宏、何春鹏课题组，根据造礁珊瑚的生物学特性，提出了造礁珊瑚基因组测序、排污、组装、注释的9步法工作流程，构建出了目前国际最优的造礁珊瑚基因组[2]。目前，NCBI共发布了88个造礁珊瑚基因组，其中，只有26个组装到了染色体水平[2]。在这26个基因组中，Wellcome
Sanger Institute（桑格研究所）发布了19个（18个NCBI参考基因组），东南大学提供了4个（1个NCBI旗舰基因组，3个NCBI参考基因组）[2]。
项目主要参与人员：陆祖宏、何春鹏、黄万龙、韩婷玉、王冰、李一鑫、郭卓君、刘云卿、毕长伟、鲁娜。
1.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_036669915.1/
2.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/?taxon=6125
3.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq
/annotation_euk/Pocillopora_verrucosa/GCF_036669915.1-RS_2024_06/
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