根据合肥市战新产业发展需求，以及合肥市未来科教融合与产业发展布局，经征求多方意见与建议，并得到聚变科学家的首肯与支持，合肥理工学院党委研究决定成立聚变工程学院。2025年12月5日，学校举行聚变工程学院揭牌仪式。校党委副书记、校长吴玉程，校党委副书记、副校长李先强为聚变工程学院揭牌，校筹备组副主任吴明在、相关职能部门与二级学院负责人、部分教职工参加揭牌仪式。
学校成立聚变工程学院旨在服务国家能源安全战略，顺应合肥综合性国家科学中心建设需要，抢抓聚变能源产业发展机遇，推动交叉学科建设与创新人才培养，助力安徽打造聚变能源科创引领高地，着力建设聚变工程创新高地和人才培养基地。
目前，合肥理工学院汇聚了一批从事聚变工程（装备制造、清洁能源领域等）相关的师资力量，得到合肥综合性国家科学中心能源研究院、中国科学院等离子物理研究所、聚变新能(安徽)有限公司等大力支持，并派出相关研究骨干担任学院领导参与建设与管理，组建由全国聚变工程领域著名专家组成的学术指导委员会，实现校院、校企合作办学，为国家聚变能源发展和合肥市聚变产业发展作出合肥理工的人才支撑贡献。
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